mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCGCAAGGATTCCTCAAGATC TCTTCAGGATCCCTGTCTGAACA GGAGACTAGGTCTATTCGATATTGCCTTGATCTTCAGGATCCCTGTCTGAACACAGAAATTGAGTGTTCGCAAGGATTCCTCAAGATCAGGGCTTCGAGTCAGCTTCCCTTTACTTCC 5 1 3' arm Pristionchus_pacificus mirbase mir-2241 7e-49 ppc-mir-2241a-4 6e-49 -46.9 ((((...(((.((((((((....(((((((((((.((((..(((...(((((((.........)))))))..)))..)))).))))))))))).)))))).))....)))...)))). (-46.90)