mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCGCAAGGATTCCTCAAGATC TCTTCAGGATCCCTGTCTGAACA GCTCTATTCGATATTGCCTTGATCTTCAGGATCCCTGTCTGAACACAGAAATTGAGTGTTCGCAAGGATTCCTCAAGATCAGGGCTTCGAGTCAGCT 5 1 3' arm Pristionchus_pacificus mirbase mir-2241 9e-48 ppc-mir-2241a-3 5e-49 -44.5 (((..((((((....(((((((((((.((((..(((...(((((((.........)))))))..)))..)))).))))))))))).)))))).))). (-44.50)