mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCACTGCTGAAGGTCCG GACTTTCAACAGGCCATACA GATGTAACTAGCAGTTGACTGAACATTTCGGACTTTCAACAGGCCATACACCTAATGTTATGTATGGCACTGCTGAAGGTCCGAAAGCTGCAAAAGAGTAAAAAAAATACGTT 1 1 3' arm Pristionchus_pacificus mirbase 100 ppc-mir-2253a 3e-17 -40.6 (((((((((.(((((..........(((((((((((((.(((((((((((..........)))))))).))).)))))))))))))))))).....)))........)))))) (-40.60)