mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC CGCTATCCATCCTGAGTTTCA AAAAGTAAAGAAGAATCTGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGGTGCCATGAATATGGGAATGATCTAGGGTTTCATGATAAATAATGGGCACTGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATGGCTTCTTCTTACTCTC ACGGCCGGGGAAGAACCAACCAAAACANNNNACTCAATTCCAAAGTCTTCTATCTAGTTTGGTTCGGTTTCTTGGTTTTTAGTTGTGAGAAAGCATTGTCTAAAAGTAAAGAAGAATCTGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGGTGCCATGAATATGGGAATGATCTAGGGTTTCATGATAAATAATGGGCACTGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATGGCTTCTTCTTACTCTCTCTCTCGAGATCGGCTC 1 0 5' arm Citrus_sinensis mirnest MIR390 0.0000000000001 csi-MIR390 6e-74 -56.9 ...(((((.((((((.((((.((((((((((.((((((((((...((((((.....(((((((...........)))))))..........)))))))))))))))).)))))))))).)))).)))))))))))... (-56.9)