mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTCTCGGGCTTCTTTGAGGAT CCTCAAAAATTCCGAGAACCA GCTATTCGCCATGCCCCCATCCTCAAAAATTCCGAGAACCACGAATTGAATGTGGTCTCGGGCTTCTTTGAGGATAAGGGCTTCGGGTCAGC 2 2 3' arm Pristionchus_pacificus mirbase mir-2241 5e-46 100 -41.6 ((((((((....((((..(((((((((((..((((((.(((((.......)))))))))))..)).)))))))))..))))..))))).))) (-41.60)