mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTAT ACATACTTCCTTGCTATCCCATA GTATCTGTATGCAGACAACATACTTCCTTGCTATCCCATATTTTATATAATGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATTTTGTGTATGGTTTT 4 1 3' arm Lottia_gigantea mirbase mir-1 0.0000000003 xtr-mir-1a-1 0.00000000002 -26.92 ....(((((((((((..(((((((((.((((.((.(((((.............))))).)))))).)))))))))..))))))))))).... (-26.92)