mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAACGAGGAGGCCGGGACCA ACTCCGGCCTCCTCGCCGGC GCCATCCTCTCGCACTCGCCGCCGCATCCGCCAACGAGGAGGCCGGGACCACCGGATCCGGTGACTCCGGCCTCCTCGCCGGCAGATCCGGCCACTCTGAGGCGAGGGGGT TGCTCTCCTCCTCTCGCTCCGCTCTCTCTCCTGCCCAAGCAATGGTCGCCCCCCCCCCCCCCCCCCAATTCTCTTCTTCCCGCAGGTGACGGCCTCCCCCGCGCACTCTCTGCTGTCGTGCCCGCCGCCGCCCGGCACGCGGGCCGCTGCCGTCGCCGCATCGTTGTCCTGCGGTCGCCATCCTCTCGCACTCGCCGCCGCATCCGCCAACGAGGAGGCCGGGACCACCGGATCCGGTGACTCCGGCCTCCTCGCCGGCAGATCCGGCCACTCTGAGGCGAGGGGGTCTCGCCCCGCTGTCGCCGCCGCCCGCTCTCTTCGCAGCGCCCGTGGCTGCCGTCCGGTCTGCTCGCTACGCCGTTGCCATCGCCCGCTCGAAGGGGATGCCGTCGATGCCTGCTTTC 4 0 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR1846 1e-25 osa-MIR1846e 2e-33 -64.9 ...((((((((((.((((..((((.(((.(((..(((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))))))..))).))).)))).....)))))))))))))) (-64.9)