mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTT CAATAAATCACATTCTTCCCAGA ATAACCTATCTACCCTGGTCTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTTAATTTCAGTATTAACAATAAATCACATTCTTCCCAGATTGTGGTTGATCTTAACA 3 3 5' arm Lottia_gigantea mirbase mir-7 0.00000002 api-mir-7 0.000000005 -27.4 .......(((.(((.((((((((((((...(((((((.(((((..((((......))))))))))))))))..)))).)))))))).))).)))....... (-27.40)