mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGCAAGATGTTGGCATAGCT CTGTGTCTCATATTGCTATC ATAATGTTTGAGTCCAGACTAGGCAAGATGTTGGCATAGCTGAGTCATATATGAACCATCAGCTGTGTCTCATATTGCTATCTTTGGGCTTGTTGTTGCAT 3 1 5' arm Lottia_gigantea mirbase mir-31 0.000005 cte-mir-31 0.0000003 -38.6 ...((((.((((((((((...(((((.(((..(((((((((((.(((....)))....))))))))))).))).)))))...)))))))))).....)))) (-38.60)