mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGCATTGTAGTTGCATTGCAT GCAATGCATCTGCAGTGCAAAC CGAACTAAGCAGTTGTGATGGTGCATTGTAGTTGCATTGCATTTGTTATAAATTATGCAATGCATCTGCAGTGCAAACATTACGATTGAAACTATCACCTA 2 0 5' arm Lottia_gigantea mirbase mir-33 0.00002 cte-mir-33 0.000001 -42.8 .((......(((((((((((.((((((((((.((((((((((............)))))))))).))))))))))..)))))))))))......))..... (-42.80)