mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGCACTGGCGGAATAATCA ATTGTTACCTGGTGTCAAAAA TGCTCCTACTTGGCACTGGCGGAATAATCACGTGATAAAATCAGTGATTGTTACCTGGTGTCAAAAAGGATTT 4 1 5' arm Lottia_gigantea mirbase 100 cte-mir-96 0.0002 -29 ...((((..(((((((..(.(.(((((((((.((((...))))))))))))).))..)))))))..))))... (-29.00)