mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAACACAGCTGGTGGTATCTTCT AGGATACCATGTTGTGTTTACA AAGAGAAGATAACTCTGTTGTGGAGGATACCATGTTGTGTTTACAGTTTTGAAACATTTGTGAACACAGCTGGTGGTATCTTCTATAAGCAGAGTATTTCA 0 2 3' arm Lottia_gigantea mirbase mir-317 0.0003 cte-mir-317 0.000005 -47.3 ....((((...(((((((((((((((((((((((((((((((((((...........)))))))))))))..)))))))))))))).)))))))).)))). (-47.30)