mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTCTGTCCTTGGCTAC GCCATGCGCTGTGAGGAGGAGAACGGGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTGGTATTGGGGGAATCTCAGCTTTGCTGAAGCGCCTTGGAGTTAGCCGGCAAGTCTGTCCTTGGCTACACCTAGCTCTCTTCTTCTAGCGTTTGGC TCCGCATCTGTGGTACCGGGAATTCGGCATTATGGCCGGGGGCACGCTTGCAGATCAAACCACATGATAGAAAAGCAGCCATGGTAGGGGAAGGAAGAAGAGAAGTAGGAAGAGTACCTGTACTGTTCAGTATGCAGTAGAACCACTGAGGCAGCTTCTGCTGGGTTGCCATGCGCTGTGAGGAGGAGAACGGGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTGGTATTGGGGGAATCTCAGCTTTGCTGAAGCGCCTTGGAGTTAGCCGGCAAGTCTGTCCTTGGCTACACCTAGCTCTCTTCTTCTAGCGTTTGGCTCTTGAGCATCCTCGAGGGCCATCTGTACCGTAGCTTGTTTGTGCCGACGATTTCCACCAAGATACATACGAATGAGTAAGTATGCAATGCTTAAAGACTGACTTATTACCTCAGAATCATGTCTCTTCAGCTCTGCATGTGCATTAGTGCATACATTACATGTTCAACATCTTGCTGTTCCTTCTGCAATGGACATGCATGAACTTGTAAGCAAAAAAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTACAGGTGTGATGGGAAACCGGTTGGTACAAGTAATGCCTGGGTGATCCTTTGAGAGGGATAAGAAGGCACGATGTTTTAGATGGATGGCGGGAGGAGTAGGTAAGTGAAGGTGAGATAAGCTAATGGAGAGGATTAAGAAGTGTTGAGGTATATGGAACGGTATATGTGATTGGTCAGAAGGGAGGA 0 1 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR169_2 4e-60 osa-MIR169c 6e-59 -77.4 ((((.((((((.((((((((((..(((.((.((((((((((((((((((((((((.(((..(((((...)))))(((((...))))))))..)))....))))))))))).)))))))))).)))))...)))))))))))))))).)))) (-77.4)