mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGCTGTCATGATGCCTTC AGGCATTATGAAGGTTGGTA GACTATCAGCTGTCATGATGCCTTCCTGTTTTGGAAGAGTTTGGGTAGGCATTATGAAGGTTGGTAATT 2 0 5' arm Lottia_gigantea mirbase 100 cte-mir-1989 0.0002 -29.2 ...((((((((.(((((((((((.((((..((.....))..)))).))))))))))).))))))))... (-29.20)