mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTATGCTGATATTCACGAGA TCGGGAATATAGGCATAATGCC GTATATTTCGGGAATATAGGCATAATGCCCGTTAATACTTGAACGTATTATGCTGATATTCACGAGATCCGCT 2 0 3' arm Lottia_gigantea mirbase 100 cte-mir-1993 0.0000008 -24.5 ((..((((((.((((((.((((((((((..(((........))))))))))))).)))))).))))))..)). (-24.50)