mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGACAGTGTGTCCTCCCTCA AGGAAGAACATTCTGTCTACATG TTCTCAGGAAGAACATTCTGTCTACATGTTACACTAACCATGAGACAGTGTGTCCTCCCTCAGGCTCA 4 1 3' arm Lottia_gigantea mirbase 100 cla-mir-1994 0.000003 -21.3 .(((.(((.((.((((.((((((.((((..........)))))))))).)))).)).))).))).... (-21.30)