mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCA GCGTTCAACCTCGGAGCCTTTGT TGTCAAGCACGTGAAATGGCGTTCAACCTCGGAGCCTTTGTCAGCGATTGAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAATGCGATGCTCC 3 2 3' arm Echinococcus_granulosus mirbase mir-124 0.000001 emu-mir-124a 3e-44 -33.8 .....((((((((...(((((((((.((.((..(((((..((((...))))...))))).)).)))))))))))..)))).)))).. (-33.80)