mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTGAGACCCTTTGATTGTC CAGCCAAAGTGACTCAGGTGTGC GCTCCCTGAGACCCTTTGATTGTCTCGTTAAACATAATTCTATATGTTAAATGTAATCAGGCAGCCAAAGTGACTCAGGTGTGC 5 1 5' arm Schistosoma_japonicum mirbase 100 sma-mir-125a 0.0000002 -27.7 ((.(((((((.(.(((((..(((((((((.((((((......)))))).)))).....)))))..))))).).)))))).).)) (-27.70)