mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTGAGACTGATAATTGCTC GCAATTATTATTCTCAGGTGT ATCCCTGAGACTGATAATTGCTCTAGTTATTATATCATTAATGAGTTTACAATAAGGGCAATTATTATTCTCAGGTGT 3 0 5' arm Schistosoma_japonicum mirbase 100 sma-mir-125b 0.0000009 -29.2 ...(((((((.(((((((((((((.(((......(((....)))......))).))))))))))))).)))))))... (-29.20)