mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGTCCATTCGCATTTCT AGGTGTTAATGGACATCATA TCTGTGAACAATCGATTCACTGATTGTCCATTCGCATTTCTTGTTAGAAACATTTTCAATTATTATCATTATTCAATGATAATGATGATAATATTTAATTCACAAGAGGTGTTAATGGACATCATATGATCGATTATTAATCATCT 1 1 5' arm Schistosoma_japonicum mirbase 100 sja-mir-219 3e-79 -47.6 ...((((..((((((((...((((.(((((((.(((((((((((..(((.....))).(((((((((((((((....))))))))))))))).........))))))))))).)))))))))))...)))))))).....)))).. (-47.60)