mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTGAGATTGTTGCATATTTACA TATTATGCAACGTTTCACTCT CTAGGGGATGAGTGAGATTGTTGCATATTTACATTGCTGGTATGTATTATGCAACGTTTCACTCTACTCCGGGGA 1 2 5' arm Schistosoma_japonicum mirbase 100 sja-mir-2162 3e-37 -31.9 ((.((((..(((((((((.((((((((..(((((.......))))).)))))))))))))))))..)))).)).. (-31.90)