mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACAAACAGCTAAACTTAT AGGTTTCGTTGTTTGTATTT GTGACAGGTATTAGGTTTCGTTGTTTGTATTTATCAATTTCTAACACATACAAACAGCTAAACTTATAACCTATCTC 2 0 3' arm Schistosoma_japonicum mirbase 100 sja-mir-3484 2e-38 -22.63 ..((.((((..(((((((.(((((((((((.................))))))))))).)))))))..)))).)).. (-22.63)