mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCCCGCTTGGAACGCT AGTTCTACGGTGTTGTGATATA GTTCACTTAATTGAGTTCTACGGTGTTGTGATATAATGATTATTTATATCACAGCCCCGCTTGGAACGCTAAAATATGAAT 4 2 3' arm Schmidtea_mediterranea mirbase 100 sme-mir-2a-1 0.000000004 -26.87 (((((.........(((((((((.((((((((((((.......)))))))))))).)))..)))))).........))))) (-26.87)