mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GACATCATTATTTGACTGTCGAT CACAGCCAAATTTGATGTCCT GTGACATTTTGCCTCTTACGGACATCATTATTTGACTGTCGATAGATATTGGTAACATTATTTTGGTAGTATCACAGCCAAATTTGATGTCCTAAATAAGGTAGTCAC 2 2 5' arm Schmidtea_mediterranea mirbase 100 sme-mir-2d 1e-56 -35 (((((....(((((.(((.((((((((..(((((.((((.((((..(((..(..........)..))).)))))))).))))).)))))))))))...)))))))))) (-35.00)