mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACACTTGGTAATTTGCTCAAACC TGAGCAAAGTTTCAAGTGTATA TTTGCCAGTATTTCAACACTTGGTAATTTGCTCAAACCAATGTCCGAAAAGGAGTCTGGTGAGCAAAGTTTCAAGTGTATATATGTGGCATTAAA 4 2 5' arm Schmidtea_mediterranea mirbase 100 sme-mir-87a 5e-49 -34.6 ..(((((((((....((((((((...(((((((..((((...(((.....)))...)))))))))))...))))))))..)))).)))))..... (-34.60)