mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGAGCAAAGCTTCAAATGAG CATTCGAAATTTTGCTCAAATCCA TTCATTGATGCGTTGATGCTTCATTCGAAATTTTGCTCAAATCCATTTTGATAATAATAATTTTCGATGGTGAGCAAAGCTTCAAATGAGATTTCACGGAATTCGGTC 2 3 3' arm Schmidtea_mediterranea mirbase 100 sme-mir-87b 1e-56 -26.1 ...((((((.(((.((...((((((.(((.(((((((((...(((((..((.(((....))).)))))))))))))))).))).))))))...))))).)..))))). (-26.10)