mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCGTCAACCAGCTGT AGCTGTTGACGAAGTATCAAAA AATCGCAGTATATTTATAGCAGCTGTTGACGAAGTATCAAAATAGTTAAATGATGATATAAATTATTTGGTCCCCGTCAACCAGCTGTTATAATGTACATTAACATCC 2 2 3' arm Schmidtea_mediterranea mirbase mir-133 1e-47 aae-mir-133 0.00008 -32.62 .......(((((((.((((((((((((((((..(.((((((.(((((.............))))))))))))..)))))).))))))))))))))))).......... (-32.62)