mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCCTATAACGTCTGATGATTAC AATCTCAGCCTGTTAATAGGAGTT CCTGTCATGATTTAGCAAGCAATCTCAGCCTGTTAATAGGAGTTTGGAAATGTTTAAATACTCCTATAACGTCTGATGATTACTTGTCAAATCATTTTACCAA 2 3 3' arm Schmidtea_mediterranea mirbase 100 sme-mir-216 9e-54 -30.8 ......(((((((..((((.((((((((..(((((.((((((((((((....)))))..)))))))))))).)))).)))).))))..)))))))........ (-30.80)