mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAATGCATTATCTGGTATGAT CATATCAGATTTGCATTATTATT ATCATTTATATTAATCATATCAGATTTGCATTATTATTATGAATTAAACATCAATAAATGCATTATCTGGTATGATATTTGAAATGAT 1 3 3' arm Schmidtea_mediterranea mirbase 100 cte-mir-277a 0.0003 -25.5 (((((((......((((((((((((.((((((..(((((((.......))).))))))))))..)))))))))))).....))))))) (-25.50)