mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTGGGATGAGCCTCGGTGGT CACCGAAGTGGTTCGATTCCACCTTTCCAGCGA ATCGCTGGGATGAGCCTCGGTGGTCCGGGGTGCAGGCTTCAAACCTGTAGTCGGTTGACACCGAAGTGGTTCGATTCCACCTTTCCAGCGAT 2 12 5' arm Schmidtea_mediterranea mirbase tRNA 1e-40 100 -41 ((((((((((((((((((((((..(((.(.((((((.......)))))).))))....))))))...)))))).........)))))))))) (-41.00)