mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGACAGACTTGCCG GCAAGTCATCCTTGGCTGCA GAGCCAAACGCTAGAAGAAGAGAGCTAGGTGTAGCCAAGGACAGACTTGCCGGCTAACTCCAAGGCGCTTCAGCAAAGCTGAGATTCCCCCAATACCAGGAGCCGGCAAGTCATCCTTGGCTGCATCCCGTTCTCCTCCTCACAGCGCATGGC TGATCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTTTTGCTTACAAGTTCATGCATGTCCATTGCAGAAGGAACAGCAAGATGTTGAACATGTAATGTATGCACTAATGCACATGCAGAGCTGAAGAGACATGATTCTGAGGTAATAAGTCAGTCTTTAAGCATTGCATACTTACTCATTCGTATGTATCTTGGTGGAAATCGTCGGCACAAACAAGCTACGGTACAGATGGCCCTCGAGGATGCTCAAGAGCCAAACGCTAGAAGAAGAGAGCTAGGTGTAGCCAAGGACAGACTTGCCGGCTAACTCCAAGGCGCTTCAGCAAAGCTGAGATTCCCCCAATACCAGGAGCCGGCAAGTCATCCTTGGCTGCATCCCGTTCTCCTCCTCACAGCGCATGGCAACCCAGCAGAAGCTGCCTCAGTGGTTCTACTGCATACTGAACAGTACAGGTACTCTTCCTACTTCTCTTCTTCCTTCCCCTACCATGGCTGCTTTTCTATCATGTGGTTAGATCTGCAAGCGTGCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTGGCGCTCCCAATGCAAAGACTTTATTGTGCCCCGTTACCAAAAGGCTAAATTCAGAAAACGGTAATCTTCGGGAGGGCAATAACTACATTTGATATAACTAAGAGAAAACACGTTAGTAAAAGGAAGACATCGGATATCATAAAAAAGGGAGGAAGA 1 1 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR169_2 4e-60 osa-MIR169c 6e-59 -68.5 ..((((..((((.((.((.((((((..((((((((((((((..((((((((((((..((....((...((((((...))))))...)).........)).)))))))))))).))))))))))))))..)))))).)).))..))))..)))) (-68.5)