mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTATTATGCAAATATTCACAAT TGTGCTTATTTGTATATTGCAC TGGCGTAGTCTATGGTGTATTGTGCTTATTTGTATATTGCACTGTTAATCTTTTGTATTATGCAAATATTCACAATTTGACCAAGCTTAAACATCC 3 0 3' arm Schmidtea_mediterranea mirbase 100 sme-mir-2162 1e-49 -24.3 ((....((.((.((((..((((((..((((((((((.((((..(.....)...)))).))))))))))..))))))...))))))))....))... (-24.30)