mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCATAGTCTATTAAGTTGGT TAACTTGATAGATATATGCATCAACG ATTACGAGATTTTATTTTCATAACTTGATAGATATATGCATCAACGAGATTTGCTATTATTTTGTTGCATAGTCTATTAAGTTGGTCGAAATGATTTTAATCGTCA 2 4 3' arm Schmidtea_mediterranea mirbase 100 sme-mir-2163 2e-55 -31 ...((((((..(((((((..(((((((((((((.((((((...(((((((........))))))))))))))))))))))))))...)))))))..))..)))).. (-31.00)