mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACATGTATAGTATTATTTGCCT GAAATAATGACTATGCATGGGACA AATAATTTTCCATTGATTTGGAAATAATGACTATGCATGGGACATTAGTAGAGCTTGTACATGTATAGTATTATTTGCCTGTCATTGGATTTATCAGCGA 2 3 3' arm Schmidtea_mediterranea mirbase 100 sme-mir-2172 5e-52 -30.1 .((((...((((.((((..((((((((((.(((((((((..(((..((.....))))).))))))))))))))))).)).)))).)))).))))...... (-30.10)