mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAATGCCCAGTGAATTTCTCGGT AAGAAATTCATTGGTTAATTTC AAAAATCATTGCACATGATACAAGAAATTCATTGGTTAATTTCATGATTATGAAAATGCCCAGTGAATTTCTCGGTAGATGAACAATTATTCATTT 3 1 3' arm Schmidtea_mediterranea mirbase 100 sme-mir-2177 1e-49 -25.5 ...(((.((((..(((..(((.(((((((((((((.((.((((((....)))))).)).)))))))))))))..))).)))..)))).)))..... (-25.50)