mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTATAAATCATCCTTGCACTAC CGTACATTGATGATTTATGAAG TTTACAATGACGACACACCCTTATAAATCATCCTTGCACTACTTATGTCGTACATTGATGATTTATGAAGGTGTGTTGCTGACTCTGC 4 0 5' arm Nematostella_vectensis mirbase 100 100 -31.9 ..........(((((((((.((((((((((((..((.((.((....)).)).))..)))))))))))).))))))))).......... (-31.90)