mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAACAAGTCCGATCTACA TAGGTCGGGCCTGGGGGGCAGG TGTGGTATTGTAGGTCGGGCCTGGGGGGCAGGTGGAAGGAATGGCGGCCAAAAGCGGCAAGGGAGAGTGATGGCTGCACTGCACTAGTTCTCTTTTGCTGCTGCGGGCTGCCAACCTCCTGCCAAACAAGTCCGATCTACAAGACCACGG 4 0 3' arm Amphimedon_queenslandica mirbase 100 100 -89.9 .(((((.(((((((((((((.((...((((((.((......((((((((...(((((((((((((((...(((.(((...)))))).)))))))))))))))...)))))))).)).))))))...)).))))))))))))).))))).. (-89.90)