mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTACGTCAATAAGGCAGC TCCCTTACTGACGCAGTTG GTGGGTTTTGAGAAGATGCGGTCCGTTGGCTATAATGTTGACAGACCACCCGCTCCCTTACTGACGCAGTTGACGCGTTTGATAGCAGGATCATAGTACGGGACCAGTTCCCCTACCAACTGGTCCCGTAACCACTATGATCCTGCTATCAAAGGCGTCAACTACGTCAATAAGGCAGCGGGTGGTCAATATACATTATTGCCAACGGACCGGTTCTCCTCAAATGTCAC 3 0 3' arm Chlamydomonas_reinhardtii mirbase 100 cre-MIR908 4e-129 -157.8 ((((..((((((.(((..((((((((((((.(((((((.....(((((((((((.(((((.(((((.(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((........))))))))))))....)))))))))))))))))))).))))))))).))))).))))).))))))))))).....))))))).))))))))))))..))).))))))..)))) (-157.80)