mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTAATTGCCGGTAGCACTGA AGTGCTGCTAGCAACTACAAGG CAAATGGGCCATCGTATTACTATCAGTGCTGCTAGCAACTACAAGGCGGGCATGAAGGTCGATTTGATCCGATCGACCTTCATGACCGCCTTGTAATTGCCGGTAGCACTGATTGTAATGCGATGGCTCATTTG 3 0 3' arm Chlamydomonas_reinhardtii mirbase 100 cre-MIR1153 4e-72 -101.6 ((((((((((((((((((((.(((((((((((..((((.((((((((((.((((((((((((((......)))))))))))))).)))))))))).))))..))))))))))).)))))))))))))))))))) (-101.60)