mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCACAGTGCCCGATTGCCG ACAATCGGGCACTGTGGCAAA CGTCGACAATCGGGCACTGTGGCAAACTGCGACAATGCCAATGGAGACGGATGAGACCGTGTTATTCCAGCAGCCGCGACTCCTGGAATGGTCACGCGGCTGAGGCACCCTTGCTGGGTACCCCAGCCGATGCCGATGTTCCAGCCGCAGTCACGGCGGCAGCCACAGCACGGCCTCATCCGTCTCCATTGGCATTGTACACCGTCTGCCACAGTGCCCGATTGCCGCCG 1 0 3' arm Chlamydomonas_reinhardtii mirbase 100 cre-MIR1159 4e-129 -149.7 ((.((.((((((((((((((((((.((.(.(((((((((((((((((((((((((.(((((((......((.((((.((((.((((((((((....((((((.((.((((.....)))).)).))))))..)))...)))))))....)))).)))).))......))))))).)))))))))))))))))))))))).).).)).)))))))))))))))))).)).)) (-149.70)