mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGGACAAGGCCAAGTCCGA GGGCTTGGCCTGGTCTACACA GCGGCTTGGTCTTTCCGCGGTGGCCTCCTCCTCAATCTTGGCCTTGCGCGCTTCGGGCTTGGCCTGGTCTACACAGCAGGCAGGGTTGGGAAGCTCCCTTACCCTGCCTGCTGTGTGGACAAGGCCAAGTCCGAAGCACGGAAGGCGAAGATTGAGGAGGAGCGTGCAGTGCGGGTCCATGGGTCGTGCCTGC 1 0 3' arm Chlamydomonas_reinhardtii mirbase 100 cre-MIR1168 3e-107 -150.9 (((((.((..((.((((((.(((((((((((((((((((.(((((.((.((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((.....)))..)))))))))))))))))))).)))))))))))))))).)).))))).))))))))))))))).)).)).)))))).....))..)).))).)) (-150.90)