mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGATCGGAGACGCAGTGAA CGCTGAGTGTCCGAATCTACT CAGTAGGATCGGAGACGCAGTGAAGCCCCCTTGCTGCTGCGATTCTTTCCGACTTACAACGTGCTCGTGGCGAGCACATTGTAGGTGTAGAGGATTGCAGCAGCAACGGGGCTCCGCTGAGTGTCCGAATCTACTG 4 0 5' arm Chlamydomonas_reinhardtii mirbase 100 cre-MIR1172 2e-73 -92.7 (((((((.(((((.((.(((((.((((((.((((((((((((((((((.(.((((((((.(((((((...))))))).))))))))).)))))))))))))))))).)))))).))))).)).))))).))))))) (-92.70)