mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGAAGATAGAGAGCACAAC TGTGCTCTCGTTGATTTTGTC GATGACAGAAGATAGAGAGCACAACCGCTCAGATGCCGGCACTCTGCGTTTGAGGTGTATGTGCTCTCGTTGATTTTGTCATC 6 1 5' arm Pinus_taeda mirbase 100 pta-MIR156a 3e-25 -41 ((((((((((....(((((((((..(((((((((((.(.....).)))))))).)))..))))))))).....)))))))))) (-41.00)