mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGACT TTGATTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGACTTCATCCGGATTTGGGCTCCAATGTTCGGATGCCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATCGG 4 0 3' arm Pinus_taeda mirbase mir-166 0.00000008 vvi-MIR166e 0.000000005 -55.6 .((((((.((((((((..((((((..((((..(((((((((((((...)))).)))))))))..))))..))))))..)))))))).)))))). (-55.60)