mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGCACTGCCTCTTCCCTGGC CAGGGACGAGTTAGGGCATGG GAGACAGGGACGAGTTAGGGCATGGGAGTTGCATATGCAGAAACGTCTGCTTCTGCCATTCTTATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTC 4 0 3' arm Pinus_taeda mirbase MIR408 0.00007 vvi-MIR408 0.000004 -44 (((.((((((.(((.(((.((((((((((.(((...(((((....)))))...))).)))))))))).))).))).)))))).))) (-44.00)