mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGAGTTTTGCCAGTTCCGCC CGGGCTGGCATAACTCCGCCC GTAGGAACAGGCGGGCTGGCATAACTCCGCCCATATTTTACTGTCAGAGATGGTCAGAGTTTTGCCAGTTCCGCCCATTCCTACTG 3 1 3' arm Pinus_taeda mirbase 100 pab-MIR1311 0.000000000001 -44 (((((((..((((((((((((.(((((.(.((((.((((......)))))))).).))))).)))))).))))))..))))))).. (-44.00)