mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTTCAGGGAGTCAAGCAGA ATGCTAGATCCGCCTGGCTCCCTGTATGCCAACTGCGAGCCTTGCTAAATATTTGTTTGCCTTGATTCATAGCTGGCGTTCAGGGAGTCAAGCAGACCTTGCG 3 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase mir-160 9e-45 ppt-MIR160i 0.000000000001 -42.5 ..((.((.((.((.((((((((((.((((((.(((.((..(..(.(((((....))))).)..)..)).))).)))))).)))))))))).)).)).)).)). (-42.50)