mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCCTGGCTCCCTGCATGCCA GCGTGTGGGGGGTCAGACAGG ATATTGGATCCGCCTGGCTCCCTGCATGCCACTTGCGAATCTTGCCAAACGTTTTGTCGGGGTTCATGGCTGGCGTGTGGGGGGTCAGACAGGCCATACA 4 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase mir-160 0.000001 ppt-MIR160i 0.00000002 -47.3 ....(((.((.(.(((((((((..(((((((((...((((((((.(((.....))).))))))))..)).)))))))..))))))))).).))))).... (-47.30)