mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCCTGGCTCCCTGCATGCCG GCGTGGAGGGAGCCAAGCAGA ATGTTGGATCCGCCTGGCTCCCTGCATGCCGCCTGTGAATGCTGTGAAGAGACTTACTAGAATTCATAGCTGGCGTGGAGGGAGCCAAGCAGACTCTGAA 3 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR160c 0.00000002 -52.8 ...(..((((.((.(((((((((.(((((((.((((((((.((((((......)))).)).)))))))).))))))).))))))))).)).)).))..). (-52.80)