mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA CCATACAGGGAGTCAGACAGA CTGCAGAAATCAATGGGGGAAACTGGCACTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTTGCGAATTTTGGCAAAACTTGTGGCAGGGTACGTAGCTGCCATACAGGGAGTCAGACAGACCTTGCATCTTCCCGGATTCTCATGA 2 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase mir-160 8e-43 ppt-MIR160g 1e-19 -56 .((.((((.((...((((((....((..(((.(((((((((((((((.((.(((((.((((((.((.......)).)))))).))))).)).))))))))))))))).))).)).....))))))..))))))))... (-56.00)